小肚子右边隐隐作痛的原因一般有以下几个原因包括：第一消化系统疾病：如慢性阑尾炎、肝胆结石、结肠炎、溃疡性结肠炎甚至是结肠肿瘤等这时候就需要做一个电子结肠镜和腹部B超来确诊；第二、对于女性来说就是妇科疾病包括盆腔炎、子宫内膜炎、附件炎、输卵管卵巢炎等这时候需要做一个白带常规检查和腹部B超等确诊病因；第三就是泌尿系统方面的包括前列腺炎、输尿管结石、肾炎、尿道炎等这时候需要做一个尿常规和腹部B超等确诊病因。