胆汁发生反流主要还是和胃幽门功能障碍，胃蠕动功能差，十二指肠异常逆蠕动以及胃部手术以后幽门缺失有很大的关系。胃的幽门具有很重要的功能，其关闭后可以防止十二指肠内容物进入胃部，如果发生胃窦部的溃疡或者炎症，有可能造成幽门括约肌瘢痕形成，影响其收缩的功能，造成其关闭不紧引起胆汁反流进入胃。另外对于胃窦部病变行胃大部切除术或者胃癌根治术的患者，如果行胃十二指肠吻合，由于手术切除了幽门丧失了其开关的功能也容易造成十二指肠内的胆汁反流。