因细菌性痢疾或其它病菌感染引起的儿童中毒性脑病最为常见。要及时降温、镇定等抗惊厥和抗感染治疗。要尽早静脉输液维持机体的水、电解质平衡，纠正酸中毒。若出现呼吸衰竭应及时吸氧或使用呼吸兴奋剂。出现脑水肿和颅内高压时应进行利尿脱水治疗。对昏迷患者应吸出痰液，保持气道通畅，及时吸氧，必要时进行气管切开。具体药物治疗有：抗惊厥药有苯巴比妥，安定，苯妥英钠等。抗高热药物有安乃近，来比林等。另外，早期使用氢化可的松、地塞米松等激素类药有快速消炎与消水肿的作用。恢复脑细胞及脑功能的脑蛋白水解物等药也要早期使用。