肝囊肿治疗的花费还需要根据治疗的方式来决定。目前临床上常见的肝囊肿的处理方式是腹腔镜下肝囊肿开窗引流，大概总体的花费需要8000-1万元。对于不能耐受手术的患者，可以考虑彩超定位下肝囊肿穿刺置管引流，囊腔内还可以注射无水乙醇烧灼，花费相比手术是明显下降的，大概需要2000-3000元，但是复发率明显的升高。而对于由于染色体异常而造成的多发性肝囊肿，如果行局限性的肝段或肝叶切除术，花费大概需要3到5万元。而如果肝脏损伤严重，引起肝硬化失代偿，门静脉高压，甚至肝功能衰竭，这种情况下需要行肝移植术，总体的花费需要30到50万。