超声波的生物效应决定于超声剂量和照射时间，在一定的剂量和照射时间下它不会对人体产生有害的作用。由于在医学上诊断用的超声波是低强度的，低于每平方厘米100毫瓦，是没有危险的。低剂量超声是潜在的致癌与致畸形因素，虽然目前医学界仍没有得到肯定的结论，但是在胎儿超声检查时应限定照射时间和照射强度。另外超声波对固体和液体都有很强的穿透本领，能量较大时可以使物质微粒作高频振动，部分能量还可以转变为热能，使局部温度升高。