胆固醇低有可能是饮食引起，也有可能是疾病造成。如果饮食不均衡，长期坚持素食，偏食，很容易造成胆固醇摄入过低，从而引起体内胆固醇下降。另外某些疾病状态可以引起继发性的低胆固醇血症，最常见的是肝脏疾病，如失代偿期肝硬化，急性肝功能衰竭，急性或亚急性肝坏死，重型肝炎，亚急性重型肝炎，急性中毒性肝细胞损伤等等，其可以造成合成胆固醇所必需的羟甲基戊二酸单酰CoA还原酶减少，从而引起血清胆固醇降低。此外甲状腺功能亢进，再生障碍性贫血，缺铁性贫血，某些先天性脂类代谢异常疾病，恶性肿瘤晚期也可以造成血清胆固醇降低。