慢性直肠粘膜炎很难彻底治愈，如果饮食及生活习惯不注意，有可能复发。临床表现多为腹泻和便秘交替出现、有时大便带黏液、排便不尽感、下腹坠胀等。本病多为急性肠炎没有治愈，病程迁延所导致，其治疗主要以口服药物和局部用药为主，口服药物如5-氨基水杨酸类、调整肠道菌群平衡药物，也可以选择灌肠和外用栓剂治疗，因为此治疗方式药物可以直达病变部位，所以治疗效果较好。