巴氏腺囊肿手术有两种方法，一个是巴氏腺囊肿开窗手术，另外一个是巴氏腺囊肿剔除手术，临床上多采用开窗手术，可以保留腺体的功能，而巴氏腺囊肿剔除手术，是将腺体全部剔除，其功能丧失。如果做开窗手术，手术顺利且没有并发症发生，全部费用大概2500块钱左右。但是因为医院级别不同、所处地区不同，所产生的费用略有差别。