房间隔缺损患者预后与缺损的类型，分流量大小，以及是否合并其他类型的心脏畸形有关系，该病患者大多数可生长到成年，但寿命缩短，大多由于充血性心力衰竭死亡。所以建议手术治疗。早期手术患者长期生存率与正常人对比无显著差别，所以推荐早期手术治疗。如有右心增大儿童，建议学龄前就手术治疗，以免影响生长发育。成人如果缺损小于5mm，没有右心衰表现，也可以观察。