造成出现三叉疼神经痛的原因比较多，目前有几种理论说法：一般考虑为三叉神经痛，有明显的家族遗传因素，多数情况下，患者可以从家族史当中发现有三叉神经痛患者聚集的情况出现。其次考虑为病毒感染学说，目前认为有一些流行性病毒，比如说疱疹病毒，有可能会通过三叉神经通路感染，导致出现三叉神经分布区域的明显疼痛。其次还应考虑为中枢神经系统的异常导致出现的疼痛。