自体脂肪填充一般是没有副作用的，手术简单安全、无疼痛、恢复快、时间短、无副作用，因为自体脂肪是由自身脂肪抽取出来进行填充的，不容易出现排斥反应，一般不会有负面影响的。相对其他的填充方式，自体脂肪是更安全的。

自体脂肪填充可能会造成血管栓塞，在自体移植过程中，一般会采取注射器将自体脂肪注射到脸部的部位，如果在过程中不注意回抽可能会造成器官发黑，也会使患者出现疼痛的现象。另外还会导致感染的现象，如果在手术过程中无菌操作不当，也会导致局部感染。如果出现这些现象，还应及时配合医生服用抗生素进行治疗，严重的还应及时就诊。