变性手术只能够解决人体外形方面的男女差异，但是对于性功能方面因为涉及到内分泌，所以不可能改变。变性手术后，为了使体内维持一定的雌激素或雄激素水平，患者需要长期进行激素治疗。男性变女性患者有可能造成血管病、肝功能异常甚至肿瘤发生。女性变男性患者会产生血压血脂增高、痤疮、冠心病、阻塞性肺疾患、睡眠呼吸暂停综合征、肝功能异常以及乳房疾病等。