畸形上颌骨可表现为发育不足或过长，也可表现为大致正常的形态及体积，但是与下颌骨和颅底的位置不协调。在面部外观上可表现为上颌前突或后缩、过长或过短、过宽或过窄等三维方向的不协调。

　　上颌两侧不对称畸形，多源于下颌不对称。常出现左右颌平面一高一低。矫正下颌不对称，需同时矫正上颌平面。在众多外科正畸患者中很大一部分表现为齿槽骨及牙齿位置的畸形。例如有些患者虽然上颌齿槽座(A)点在正常范围内，但上颌前牙及齿槽骨前突，这样的成人患者采用上颌前部截骨术可获得满意效果。

　　上颌后部齿槽骨过长是前牙开颌的原因之一，上颌后部根尖下截骨术减低后牙槽高度，关闭开颌，较之单纯使用传统正畸方法可获得更稳定的效果。有些患者上颌骨眶下区明显凹陷，可表现为下颌前突、双颌前突或其他畸形，在矫冶畸形的同时，需在眶下区作自体骨或骨代用品移植以矫正眶下凹陷。