滴虫性阴道炎的治疗主要为全身用药，临床主要选择的药物为甲硝唑和替硝唑，初次治疗可选择甲硝唑两课单词口服，或替硝唑两课单词口服，或甲硝唑400毫克，每日两次口连用七日，服药物治愈率为90%到95%。甲硝唑用药期间及停药24小时之内，替硝唑用药期间及停药72小时之内，禁止饮酒，哺乳期用药，不宜哺乳。滴虫性阴道炎主要由性传播，性伴侣应同时进行治疗，并告知患者及性伴侣治疗期间应避免无保护性交。