月经期间腹部疼痛是由于在月经周期的黄体期，黄体生成素促使黄体细胞分泌大量的雌激素和孕激素，使二者在血液中浓度明显升高。二者浓度升高将对下丘脑和腺垂体产生负反馈抑制，使卵泡刺激素、黄体生成素减少。如果不受孕，由于卵泡刺激素和黄体生成素明显减少，黄体功能停止，孕激素和雌激素血中浓度明显下降，导致子宫内膜剥脱，发生流血，成为月经。而在子宫内膜剥脱过程中会出现毛细血管、平滑肌的收缩，以及子宫内膜的新生，这些都能导致行经期间腹痛。