甲状腺疾病治疗最佳的方法需要根据疾病的具体情况来选择最合适的方案，甲状腺疾病包括有炎症、功能异常以及甲状腺肿瘤。甲状腺急性化脓性炎症需要选择有效的抗菌素进行治疗，而亚急性甲状腺炎和慢性淋巴细胞性甲状腺炎，一般只需要进行对症处理，密切观察病情即可。甲状腺功能减退症需要补充甲状腺素治疗。甲亢的需要进行抗甲亢药物口服或者碘131。甲状腺肿瘤，需要详细评估肿瘤的大小，有没有合并症，比如压迫症状以及肿瘤的性质，然后再决定具体的治疗方式，比如进行手术治疗等。