在临床上与甲状腺相关的疾病诊断时，经常会需要查甲状腺过氧化酶抗体。这个指标主要是反映自身免疫因素相关的情况。在各种自身免疫性甲状腺疾病，包括甲状腺功能亢进症，自身免疫性甲状腺炎都会出现抗体的水平升高。相对来说，甲亢时这个指标升高的相对低一点，轻度或者中度升高，而自身免疫性甲状腺炎，比如桥本甲状腺炎时的过氧化物酶抗体升高得更明显一些。