生殖器疱疹的诊断一般可凭，不洁性生活史和典型的临床表现，即可作出诊断。必要时可结合实验室病毒培养，抗原检测，核酸扩增试验，血清学检测等辅助检查方法来协助诊断。从皮损处取标本进行病毒培养，分型和药敏试验，可发现是否有单纯疱疹病毒和细胞病变。从皮损处取标本然后直接用直接免疫荧光试验或酶联免疫试验检查其中的HSV抗原，是临床上最常用的快速诊断方法。