棘阿米巴角膜炎在临床并不多见，通常是由于棘阿米巴原虫感染引起。这种疾病常见于长期佩戴角膜接触镜、角膜外伤、角膜移植及接触污染的水源等。对于这种疾病一般以药物治疗为主，可以给予新霉素、氯已定或咪康唑等治疗，口服伊曲康唑或者酮康唑也可以用于该疾病的治疗。治疗时间尽量要长，至少三个月以上，直到感染症状完全控制。在疾病期间不可随意中断药物。