子宫内膜组织异位到卵巢上，周期性的生长发育萎缩坏死，就会形成卵巢巧克力囊肿。卵巢巧克力囊肿一般需要做腹腔镜手术来切除囊肿治疗，术后还需要打针预防巧克力囊肿再次复发，通常是打曲普瑞林针来预防复发，常见的副作用是会引起阴道的干涩、性交困难，同时还会引起闭经和潮红盗汗等症状；由于雌激素水平低下，长期使用还可能会导致引起轻度的骨质丢失；一般说来是在治疗停止后六到九个月左右恢复正常，有的女性还会出现阴道少量出血表现，甚至是发痒，皮疹等过敏反应。