晨起时咽喉干痛通常有几下几个原因，有些患者因肥胖，扁桃体肥大，腺样体肥大，软腭低垂，鼻腔通气不佳等原因睡眠张口呼吸，空气长期得不到鼻腔的加温加湿，导致晨起时咽喉干痛。有些患者是是反流性食管炎，胃酸反流，至咽喉部，烧灼咽喉部的黏膜引起。最常见的是慢性咽喉炎，咽喉部的黏膜充血肿胀，粘膜下淋巴组织增生产生干痒痛异物感等症状。