巧克力囊肿复发之后的治疗，要根据患者的病情，年龄，有没有生育要求而定。如果患者术后复发，巧克力囊肿比较大，而且患者没有生育要求，一般建议患者再次行手术切除或者是，穿刺引流，因为巧克力囊肿太大，容易出现破裂，而且保守治疗效果不好。如果患者有生育要求，这种情况多选择，穿刺引流，术后配合，药物治疗，3到6个月，然后尽快怀孕，如果不能自然受孕，就做试管婴儿。因为手术对卵巢的破坏比较大，所以有生育者不建议再次行手术治疗。如果巧克力囊肿比较小，一般还是建议使用药物治疗，临床当中比较常用的药物有亮丙瑞林，1月使用一次，连续3到6个月就可以了。