泌尿系感染致病菌有很多。最常见的是细菌感染，比如导致泌尿系感染、肾盂肾炎的比如大肠埃希氏菌、变形杆菌、产气杆菌、克雷白杆菌、葡萄球菌、绿脓杆菌；比如导致包皮龟头炎的真菌感染、白色念珠菌感染、酵母样真菌感染；导致非淋菌性尿道炎的衣原体支原体感染；导致淋病的革兰氏阴性双球菌就是淋病奈瑟氏菌感染；腺病毒导致的出血性膀胱炎；梅毒螺旋体导致的梅毒；艾滋病病毒导致的艾滋病等等