肺结核的病原菌为结核分枝杆菌，当结核分支杆菌侵入人体时，人体会通过免疫系统对结核分支杆菌产生特异性的免疫反应，是否感染结核菌取决于结核菌的毒力和肺泡巨噬细胞的杀菌能力，当人体免疫功能低下时，就会感染结核菌，主要通过呼吸道传播，在咳嗽、大笑、大声谈话时结核菌可以排到空气中而传播，咳嗽是排出结核菌的主要方式，传染源是痰菌涂片阳性的肺结核患者。