打针是肌肉注射，是一种全身性的用药，药物通过肝肾代谢，副作用大，而灌肠一般有辅助排便的灌肠和药物保留灌肠，辅助性排便灌肠一般应用温水或者开塞露灌肠，主要针对便秘的病人，而药物保留灌肠是针对结直肠病变而采取的一种治疗手段，如溃疡性结肠炎应用美沙拉嗪灌肠液治疗，是局部用药的一种，药物经局部吸收，吸收量较少，副作用相对小，较打针相比危害小。