病人进入晚期既艾滋病期，病人会出现各种机会性感染及肿瘤。病人会出现原因不明的不规则发热超过一个月，体温38摄氏度以上。出现短期内体重下降百分之十以上。出现慢性腹泻一个月以上，每天大便三次以上。病人会出现口腔念珠菌感染。出现单纯疱疹病毒或带状疱疹病毒感染，可出现肺孢子虫肺炎，活动性结核，弓形虫脑病以及神经系统占位，出现中青年痴呆以及皮肤内脏的卡波西肉瘤、淋巴瘤等提示病人进入晚期。