化脓性扁桃体炎首先要应用抗菌素控制感染，首选的抗菌素为青霉素，用药3天，症状无缓解的，需要更换为头孢类抗菌素，或是取脓液做细菌培养，找到致病菌选取敏感的抗菌素。出现高热疼痛明显的患者，还需要应用解热镇痛药物，合并病毒感染的患者配合应用抗病毒的药物。部分病情严重的患者，可适量应用糖皮质激素。同时要注意休息，多饮水和流质饮食，补充液体量。