如前所述，动脉硬化性闭塞症造成的慢性下肢缺血，其自然病程并不会因为血管重建术而得到延缓，甚至有时会因为手术造成的血管内皮损伤，而加速动脉硬化的发展。同时，血管重建的手术，无论是使用支架、人工血管或自体血管，都需要给予相当长时间的足量口服抗凝和抗血小板药物治疗，以预防移植血管或支架内的血栓形成。所以，在手术成功后，即需要长期服用的主要有抗血小板(如阿司匹林)及抗凝(如华法林)等药物。同时要针对病人已经存在的高脂血症、高血压、糖尿病给予药物治疗，以延缓动脉硬化的发展。