所谓布加综合征根治性手术是指在体外循环下或常温下行下腔静脉切开，病变完整切除的术式。该术式适用于局限性狭窄，伴新鲜血栓形成，且溶栓治疗无效时；或弥漫性狭窄，狭窄段较长或同时合并肝静脉开口堵塞的布加综合征病人。虽然术式的名称是根治，但有些情况下无法将所有的病变完全切除，比如肝静脉堵塞范围广或下腔静脉陈旧性血栓。在行该术式后，因为有可能导致静脉内膜的损伤，使术后出现损伤内膜表面血小板的聚集，导致局部血栓形成而复发，故术后需要长期甚至终生抗凝。