由于卵泡囊肿的类型不同，所以并不是所有的囊肿都会自然消掉。常见的生理性黄体囊肿，一般在月经干净以后可以自然消掉，所以不需要进行特殊的处理治疗。如果是由于炎症引起的炎性囊肿，使用消炎药进行对症治疗以后，囊肿才会自然消掉。如果是由于高水平的雌孕激素刺激导致的囊肿，通常是不会自然消掉的。在小于五公分以下的时候，可以考虑口服金刚藤胶囊和桂枝茯苓丸来进行调理治疗，囊肿大于五公分以上，必须要考虑手术切除。