发热39度属于是高热，对于2岁孩子来说比较危险，应该及时去医院就诊。急查血常规、C反应蛋白、必要时做X线胸片检查，明确感染菌。病毒感染可以用解热镇痛药物及抗病毒药物像利巴韦林等治疗。细菌感染的需要及早使用抗生素，像头孢类药物、青霉素、红霉素等，配合使用解热镇痛药。无论病毒还是细菌感染的引起的发热，都可以配合使用物理降温法。