受检查者取肘膝位，医生将润滑的戴手套的手指插入直肠，通过手指触诊直肠、肛门以及前列腺和其他的组织。这种检查方法可以对很多疾病进行检查。可以用于诊断直肠肿瘤的筛查；用于诊断前列腺疾病，特别是前列腺肿瘤和良性前列腺增生；用于估计的肛门括约肌张力，判断一些排便障碍的发病原因；在女性中，用于妇科内脏器官的触诊；初步诊断肛门疾病，例如痔疮、息肉、肛乳头的诊断。直肠镜检查之前常规进行直肠指检，在新生儿中排除肛门闭锁。