在肛周脓肿早期可以口服抗生素治疗，比如青霉素类，头孢类以及甲硝唑等抗生素。也可以使用中药金黄膏或者黄玉膏外敷，同时可以配合，中药熏蒸坐浴，比如说可以选用花椒、艾叶、蒲公英、紫花地丁、黄柏、煎汤熏蒸，坐浴，一天两次，一次15到20分钟。如果脓肿已经破溃，可以填塞生肌膏纱条，使用药物治疗，如果无效，可以选择手术治疗。