引起肚子两侧疼的原因有很多，胃部疾病、肠道疾病、肝胆疾病、腹部肌肉的拉伤或者软组织损伤等都可能引起这种症状。如果是胃部疾病的话患者可能平时就会出现恶心、反酸、腹胀、腹痛等胃肠道症状。如果是肠道疾病的话患者有可能会出现腹泻、腹痛、便血等症状。如果是肝胆疾病的话患者一般会有厌食、恶心、消瘦、面色发黄等。建议患者到医院详细检查肝功能、胃镜、肠镜等明确诊断对症治疗。