扁桃体摘除手术，虽然是耳鼻喉科常见操作，但是“作易精难”。概括起来常见的后遗症有以下几种：一是出血，又分为24小时内的原发性出血和超过24小时的继发性出血；二是术创感染；三是局部黏膜疤痕黏连，严重的会影响发音共鸣；四是继发舌咽神经痛，表现有明显的耳道疼痛；五是颈深部的感染，皮下气肿；六是其他一些罕见的并发症，例如脓毒血症，肾脏、关节病变加重等等。