碘甘油主要用于治疗口腔粘膜溃疡、牙龈炎、冠周炎，属于一种外用药物。用棉签蘸取少量涂抹于患处，一日2-4次，效果还是比较好。此外，碘甘油还可以用于消毒、杀菌、防腐等，其作用机制是使菌体蛋白质变性、死亡，对细菌、真菌、病毒均有杀灭作用。应用碘甘油时，偶尔可见过敏反应，比如皮疹，一旦出现过敏反应，立即停止使用。