手术治疗是唇腭裂唯一的治疗方法。新生儿的组织单薄，机体抵抗力低，经不起手术打击，所以不主张此时手术。最好的时机是6-9个月，此时病儿有一定抵抗力，门齿已萌出，及时手术还可避免上门齿外突畸形。事实证明术后恢复也快。腭裂手术时间要再晚些，为病儿口腔太小时手术进行困难，但最好不得迟于5岁。手术最好选择在春秋季，术后还要进行必要的语言训练，以便为将来上学创造条件。