引起腭裂的原因除了遗传因素和药物影响外还有主要指胚胎在母体内发育的环境如果受到干扰可以影响胚胎的生长发育，营养有调查发现已生过畸形儿的妇女中有的在怀孕早期有明显缺钙、磷、铁和维生素B、C、D等情况妇女怀孕期间的呕吐和偏食可影响营养摄入造成维生素等的缺乏而影响胎儿正常发育，感染和损伤母体在怀孕初期如遇某种损伤或病毒感染如风疹等可能成为唇裂和腭裂发生的原因，内分泌的影响怀孕早期因生理上、精神上或损伤等可造成内分泌失调从而导致发生畸形。孕妇上呼吸道感染、风疹等;接触X射线、电脑辐射等;服用抗癫痫药、类固醇激素或抗肿瘤药物、抗组胺药、长期接触农药、长期烟酒刺激等，都可能造成遗传基因的突变等一系列胎儿唇裂。