菌斑性牙龈炎的发病机制主要是菌斑性龈炎属于慢性感染性疾病，其使动因子为堆积在龈缘牙面上的牙菌斑中的微生物，菌斑微生物及其产物引起机体的免疫反应，促进因素有牙石、不良修复体、食物嵌塞、牙列拥挤、口呼吸等，可加重菌斑堆积，继而存进菌斑性龈炎的发展。牙龈炎患者的龈缘附近堆积的菌斑较多，口内菌斑的菌量，细菌的种类较健康人口内的多，并且革兰氏阳性菌的比例下降，革兰氏阴性菌的比例上升，以牙龈卟啉单胞菌、中间普氏菌、梭形杆菌和螺旋体比例增高较明显。