深覆合的危害在于颞下颌关节紊乱，它会迫使下颌骨处于后位，由于颞下颌关节受到压力增大，容易引起关节疼痛、弹响等症状。还会导致牙齿过度磨耗，由于上下牙咬合距离增长，刺激咀嚼肌过度生长，会引起牙齿过度磨耗，进而引发牙齿酸痛、敏感等问题。还有会导致经常咬破自己的上牙龈，造成咬合创伤。另外牙齿咬合太深容易导致脸部下半部分过短、下颌后缩、下巴过短的情况，造成面部比例不协调，对颜值或多或少有影响。