术后可能会出现一些并发症，比如：伤口可有轻度渗血，用消毒纱布轻轻压迫渗血处3～5分钟就可止血，或是使用止血药；出现感染，一般严格执行无菌操作，发生感染的几率很低。如果有感染迹象，需抗感染治疗；手术后可能出现手术部位肿胀，额枕部用弹力绷带环形包扎可减轻肿胀；严格控制供发区的切割宽度、缝合时对合整齐可预防瘢痕形成，只有极少数患者出现瘢痕。瘢痕体质者不宜手术；感觉迟钝和麻木，手术过程中不可避免会损伤浅表神经，可能出现感觉迟钝和麻木，通常数月到1年时间可以恢复；一过性手术引起的脱发，部分患者在术后2-4周可发生移植区周围毛发脱落，但2-3个月后会再生长。