随着根尖部的炎症肉芽组织病变体积不断增大，血运难以抵达肉芽肿中心，病变中央的组织细胞发生坏死，液化，形成脓液，并潴留于根尖部的脓腔内，成为根尖周脓肿，临床上又称为慢性牙槽脓肿，此时包绕脓腔的肉芽组织，周围缺乏纤维被膜，当根尖部的脓液穿通骨壁及软组织可形成窦道，当局部引流不畅使和机体抵抗力下降，慢性根尖周脓肿又可以急性发作的形式表现出来。