小肚子会隐隐作痛的原因有很多诊断起来较复杂，需要详细询问病史，给予鉴别诊断，如果患者最近生活压力比较大，经常熬夜，心情比较紧张，有可能是肠痉挛引起的疼痛。如果患者出现恶心呕吐，并伴有腹泻，腹胀，腹痛等消化系统症状。此时的重点考虑是否为急性肠炎引起的疼痛，如果患者为女性，在重点可以排除是否为妇科疾病带来的，如急性盆腔炎，子宫内膜炎等