肠胃炎引起发烧，考虑是由于病原微生物感染所导致的肠道感染，所以在治疗上，最好能明确导致发热的感染源是哪一种，然后应用敏感的抗生素。比如诺氟沙星，左氧氟沙星，肠炎宁等药物治疗。同时，要给予退热等对症治疗，补充体液，以免引起脱水等并发症。症状逐渐缓解后，可以添加双歧杆菌三联活菌进行治疗，调节肠道功能，和抗生素分开服用就可以。