自闭症一般在三岁前缓慢起病，多数患者伴有精神发育迟滞，远期预后差。47%-77%预后不良，70%社会适应障碍。五岁时语言发育水平对预后影响很大，若仍缺乏有意义的语言，不会说话，预后很差。良好的训练、教育有助于改善预后。预后不良的相关因素有:女性、幼儿期刻板动作和异常行为突出、自伤行为、操作性智商低、少年期癫痫发作等。