三叉神经末梢到脑干核团的任何部位病变，均可能会导致三叉神经疼痛。比如肿瘤的机械性压迫，或者是神经根部局部的脱髓鞘的变化，动脉瘤，血管畸形，蛛网膜炎，多发性的硬化症。有可能是因为大脑的神经元过度兴奋属于某种感觉性的癫痫发作。有可能是因为感冒，邻近组织炎症，糖尿病，中毒而引起，有时候因为疱疹的神经痛，可继发三叉神经痛。