先天性心脏病的病因是多种的可能与与染色体畸变有关，但是大多数先天性心脏病是多基因的遗传缺陷，如果是染色体的畸变导致的，可能与遗传有关系，特别是一些基因的缺陷遗传的概率是非常高的。如果是因为母亲怀孕期早期有病毒感染，比如说风疹，流行性感冒，腮腺炎，科萨奇病毒或者是有遗传代谢性的疾病，有糖尿病，苯丙酮尿症，接触了放射线，使用了一些药物，宫内缺氧等等引起的先天性心脏病是不可能遗传的。