儿童病毒性脑炎如果没有及时治疗，会遗留一些后遗症。最常见的就是癫痫，主要表现为发作性的意识丧失伴抽搐，每次数分钟，需要药物控制。其次也可能会遗留一些肢体活动不灵活，如偏瘫、肌张力增高等症状，严重影响生活，需要及时康复治疗。除此之外，也可能会出现一些智力的障碍，出现记忆力下降、反应迟钝，也可以影响学习及生活，所以病毒性脑炎药及早治疗，这样才能防止发生后遗症。