巧克力囊肿是由于子宫内膜组织异位到卵巢上生长发育萎缩坏死而导致，通常会引起进行性的痛经以及不孕等表现，当巧克力囊肿小于五公分以下，而且又没有明显痛经表现的时候，可以考虑服用短效避孕药或者是打曲普瑞林针来进行对症治疗，但是这时候不一定能够完全治愈，如果巧克力囊肿大于五公分以上，同时伴有严重的痛经，就需要考虑采用腹腔镜手术来进行手术切除治疗，通常是可以治愈。只是在治愈以后，可能会有再次复发的几率。