孕妇诊断为功能性消化不良的应明确病因，给予针对性的对症治疗。第一个是一般治疗，帮助患者认识和理解病情改善生活习惯，避免烟咖啡酒及非甾体类抗炎药，避免个人生活当中会诱发症状的食物。第二个是应用抑制胃酸的药物，包括质子泵抑制剂和HR受体拮抗剂，如奥美拉唑，法莫替丁。第三个就是应用促胃动力药物，改善与进餐相关的上腹部症状以上腹饱胀，早饱嗳气为主要症状的患者优先使用。如吗丁啉，莫沙必利。第四个就是精神心理方面疏导和药物治疗。